Protein–RNA interactions for Protein: Q06623

HDA3, HDA1 complex subunit 3, yeastyeast

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3Q06623 BUB1YGR188C 3066 nt2.93□□□□□ -1.94
HDA3Q06623 DYN2YDR424C 279 nt2.92□□□□□ -1.94
HDA3Q06623 MBB1YJL199C 327 nt2.92□□□□□ -1.94
HDA3Q06623 KTI11YBL071W-A 249 nt2.92□□□□□ -1.94
HDA3Q06623 YBR206WYBR206W 324 nt2.92□□□□□ -1.94
HDA3Q06623 TAO3YIL129C 7131 nt2.92□□□□□ -1.94
HDA3Q06623 YBT1YLL048C 4986 nt2.91□□□□□ -1.94
HDA3Q06623 NOP14YDL148C 2433 nt2.91□□□□□ -1.94
HDA3Q06623 HSH155YMR288W 2916 nt2.91□□□□□ -1.94
HDA3Q06623 OST4YDL232W 111 nt2.91□□□□□ -1.94
HDA3Q06623 YIL169CYIL169C 2988 nt2.91□□□□□ -1.94
HDA3Q06623 RPS22AYJL190C 393 nt2.91□□□□□ -1.94
HDA3Q06623 ENV11YGR071C 2583 nt2.91□□□□□ -1.94
HDA3Q06623 MOT1YPL082C 5604 nt2.91□□□□□ -1.94
HDA3Q06623 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt2.9□□□□□ -1.95
HDA3Q06623 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt2.9□□□□□ -1.95
HDA3Q06623 TUS1YLR425W 3924 nt2.89□□□□□ -1.95
HDA3Q06623 RGC1YPR115W 3252 nt2.89□□□□□ -1.95
HDA3Q06623 YLR278CYLR278C 4026 nt2.89□□□□□ -1.95
HDA3Q06623 APL2YKL135C 2181 nt2.88□□□□□ -1.95
HDA3Q06623 CMC4YMR194C-B 222 nt2.88□□□□□ -1.95
HDA3Q06623 CDC31YOR257W 486 nt2.88□□□□□ -1.95
HDA3Q06623 MMS1YPR164W 4224 nt2.88□□□□□ -1.95
HDA3Q06623 DGR2YKL121W 2559 nt2.88□□□□□ -1.95
HDA3Q06623 YPL216WYPL216W 3309 nt2.87□□□□□ -1.95
HDA3Q06623 AMS1YGL156W 3252 nt2.87□□□□□ -1.95
HDA3Q06623 CAF120YNL278W 3183 nt2.87□□□□□ -1.95
HDA3Q06623 VPS8YAL002W 3825 nt2.86□□□□□ -1.95
HDA3Q06623 ILS1YBL076C 3219 nt2.86□□□□□ -1.95
HDA3Q06623 SMC6YLR383W 3345 nt2.86□□□□□ -1.95
HDA3Q06623 RPS30BYOR182C 192 nt2.86□□□□□ -1.95
HDA3Q06623 IFH1YLR223C 3258 nt2.86□□□□□ -1.95
HDA3Q06623 SEC7YDR170C 6030 nt2.85□□□□□ -1.95
HDA3Q06623 ECM29YHL030W 5607 nt2.85□□□□□ -1.95
HDA3Q06623 MAK10YEL053C 2202 nt2.84□□□□□ -1.95
HDA3Q06623 PHO91YNR013C 2685 nt2.84□□□□□ -1.95
HDA3Q06623 YPR203WYPR203W 309 nt2.84□□□□□ -1.95
HDA3Q06623 MRD1YPR112C 2664 nt2.84□□□□□ -1.96
HDA3Q06623 NUM1YDR150W 8247 nt2.83□□□□□ -1.96
HDA3Q06623 YDR239CYDR239C 2364 nt2.82□□□□□ -1.96
HDA3Q06623 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.82□□□□□ -1.96
HDA3Q06623 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.82□□□□□ -1.96
HDA3Q06623 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.82□□□□□ -1.96
HDA3Q06623 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.82□□□□□ -1.96
HDA3Q06623 YER138CYER138C 5268 nt2.82□□□□□ -1.96
HDA3Q06623 YER160CYER160C 5268 nt2.82□□□□□ -1.96
HDA3Q06623 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.82□□□□□ -1.96
HDA3Q06623 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.82□□□□□ -1.96
HDA3Q06623 YJR027WYJR027W 5268 nt2.82□□□□□ -1.96
HDA3Q06623 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.82□□□□□ -1.96
HDA3Q06623 YML039WYML039W 5268 nt2.82□□□□□ -1.96
HDA3Q06623 YML045WYML045W 5268 nt2.82□□□□□ -1.96
HDA3Q06623 YMR050CYMR050C 5268 nt2.82□□□□□ -1.96
HDA3Q06623 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.82□□□□□ -1.96
HDA3Q06623 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.82□□□□□ -1.96
HDA3Q06623 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.82□□□□□ -1.96
HDA3Q06623 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.82□□□□□ -1.96
HDA3Q06623 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.82□□□□□ -1.96
HDA3Q06623 CYR1YJL005W 6081 nt2.82□□□□□ -1.96
HDA3Q06623 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt2.82□□□□□ -1.96
HDA3Q06623 COX12YLR038C 252 nt2.82□□□□□ -1.96
HDA3Q06623 RSE1YML049C 4086 nt2.82□□□□□ -1.96
HDA3Q06623 YOR019WYOR019W 2193 nt2.81□□□□□ -1.96
HDA3Q06623 YNL018CYNL018C 1839 nt2.81□□□□□ -1.96
HDA3Q06623 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt2.8□□□□□ -1.96
HDA3Q06623 SOM1YEL059C-A 225 nt2.8□□□□□ -1.96
HDA3Q06623 RPL33AYPL143W 324 nt2.8□□□□□ -1.96
HDA3Q06623 MET18YIL128W 3099 nt2.8□□□□□ -1.96
HDA3Q06623 PRP5YBR237W 2550 nt2.8□□□□□ -1.96
HDA3Q06623 SAP190YKR028W 3102 nt2.79□□□□□ -1.96
HDA3Q06623 YDR521WYDR521W 336 nt2.79□□□□□ -1.96
HDA3Q06623 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt2.79□□□□□ -1.96
HDA3Q06623 RAX2YLR084C 3663 nt2.79□□□□□ -1.96
HDA3Q06623 ALK1YGL021W 2283 nt2.79□□□□□ -1.96
HDA3Q06623 MLH3YPL164C 2148 nt2.78□□□□□ -1.96
HDA3Q06623 TRS130YMR218C 3309 nt2.78□□□□□ -1.97
HDA3Q06623 SRO77YBL106C 3033 nt2.77□□□□□ -1.97
HDA3Q06623 YIL174WYIL174W 228 nt2.77□□□□□ -1.97
HDA3Q06623 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt2.77□□□□□ -1.97
HDA3Q06623 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.77□□□□□ -1.97
HDA3Q06623 TTI1YKL033W 3117 nt2.76□□□□□ -1.97
HDA3Q06623 CHS6YJL099W 2241 nt2.76□□□□□ -1.97
HDA3Q06623 YDL118WYDL118W 381 nt2.76□□□□□ -1.97
HDA3Q06623 STF2YGR008C 255 nt2.76□□□□□ -1.97
HDA3Q06623 ESL1YIL151C 3357 nt2.75□□□□□ -1.97
HDA3Q06623 ISW1YBR245C 3390 nt2.75□□□□□ -1.97
HDA3Q06623 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt2.75□□□□□ -1.97
HDA3Q06623 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt2.75□□□□□ -1.97
HDA3Q06623 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.75□□□□□ -1.97
HDA3Q06623 MSH5YDL154W 2706 nt2.74□□□□□ -1.97
HDA3Q06623 BUD2YKL092C 3315 nt2.74□□□□□ -1.97
HDA3Q06623 YPP1YGR198W 2454 nt2.74□□□□□ -1.97
HDA3Q06623 ESL2YKR096W 3588 nt2.74□□□□□ -1.97
HDA3Q06623 JSN1YJR091C 3276 nt2.73□□□□□ -1.97
HDA3Q06623 TCB2YNL087W 3537 nt2.73□□□□□ -1.97
HDA3Q06623 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.73□□□□□ -1.97
HDA3Q06623 NUP100YKL068W 2880 nt2.72□□□□□ -1.97
HDA3Q06623 ESC1YMR219W 4977 nt2.72□□□□□ -1.97
HDA3Q06623 AXL1YPR122W 3627 nt2.71□□□□□ -1.98
HDA3Q06623 TRA1YHR099W 11235 nt2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 54.7 ms