Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GABPAQ06546 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms