Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUCB1Q02818 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms