Protein–RNA interactions for Protein: Q02785

PDR12, ATP-dependent permease PDR12, yeastyeast

Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR12Q02785 YER046W-AYER046W-A 330 nt-1.01□□□□□ -2.57
PDR12Q02785 YPR172WYPR172W 603 nt-1.01□□□□□ -2.57
PDR12Q02785 snR33snR33 183 nt-1.01□□□□□ -2.57
PDR12Q02785 HTB1YDR224C 396 nt-1.02□□□□□ -2.57
PDR12Q02785 PHO80YOL001W 882 nt-1.02□□□□□ -2.57
PDR12Q02785 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt-1.03□□□□□ -2.57
PDR12Q02785 NFU1YKL040C 771 nt-1.03□□□□□ -2.57
PDR12Q02785 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt-1.03□□□□□ -2.57
PDR12Q02785 snR36snR36 182 nt-1.03□□□□□ -2.57
PDR12Q02785 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt-1.04□□□□□ -2.58
PDR12Q02785 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt-1.05□□□□□ -2.58
PDR12Q02785 YJL114WYJL114W 681 nt-1.05□□□□□ -2.58
PDR12Q02785 GSP1YLR293C 660 nt-1.05□□□□□ -2.58
PDR12Q02785 GIM5YML094W 492 nt-1.05□□□□□ -2.58
PDR12Q02785 RTR2YDR066C 591 nt-1.06□□□□□ -2.58
PDR12Q02785 CDC33YOL139C 642 nt-1.06□□□□□ -2.58
PDR12Q02785 ATP15YPL271W 189 nt-1.06□□□□□ -2.58
PDR12Q02785 YHL012WYHL012W 1482 nt-1.07□□□□□ -2.58
PDR12Q02785 SPO12YHR152W 522 nt-1.07□□□□□ -2.58
PDR12Q02785 PRP21YJL203W 843 nt-1.07□□□□□ -2.58
PDR12Q02785 YPL044CYPL044C 549 nt-1.07□□□□□ -2.58
PDR12Q02785 YPL205CYPL205C 345 nt-1.07□□□□□ -2.58
PDR12Q02785 YFR057WYFR057W 456 nt-1.08□□□□□ -2.58
PDR12Q02785 AFB1YLR040C 675 nt-1.08□□□□□ -2.58
PDR12Q02785 GPG1YGL121C 381 nt-1.09□□□□□ -2.58
PDR12Q02785 RFA3YJL173C 369 nt-1.09□□□□□ -2.58
PDR12Q02785 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt-1.1□□□□□ -2.58
PDR12Q02785 COG6YNL041C 2520 nt-1.1□□□□□ -2.59
PDR12Q02785 RMD6YEL072W 696 nt-1.1□□□□□ -2.59
PDR12Q02785 BET4YJL031C 984 nt-1.1□□□□□ -2.59
PDR12Q02785 YJL120WYJL120W 324 nt-1.1□□□□□ -2.59
PDR12Q02785 YLR402WYLR402W 192 nt-1.1□□□□□ -2.59
PDR12Q02785 YGL204CYGL204C 306 nt-1.11□□□□□ -2.59
PDR12Q02785 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt-1.11□□□□□ -2.59
PDR12Q02785 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt-1.12□□□□□ -2.59
PDR12Q02785 YPL185WYPL185W 396 nt-1.12□□□□□ -2.59
PDR12Q02785 YPR096CYPR096C 303 nt-1.14□□□□□ -2.59
PDR12Q02785 COX8YLR395C 237 nt-1.15□□□□□ -2.59
PDR12Q02785 FAR3YMR052W 615 nt-1.15□□□□□ -2.59
PDR12Q02785 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt-1.15□□□□□ -2.59
PDR12Q02785 YJL032WYJL032W 315 nt-1.16□□□□□ -2.6
PDR12Q02785 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt-1.17□□□□□ -2.6
PDR12Q02785 BI3Q0115 1554 nt-1.18□□□□□ -2.6
PDR12Q02785 SUT2YPR009W 807 nt-1.18□□□□□ -2.6
PDR12Q02785 YIL089WYIL089W 618 nt-1.19□□□□□ -2.6
PDR12Q02785 ARV1YLR242C 966 nt-1.19□□□□□ -2.6
PDR12Q02785 YOR345CYOR345C 351 nt-1.2□□□□□ -2.6
PDR12Q02785 TFB6YOR352W 1032 nt-1.2□□□□□ -2.6
PDR12Q02785 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt-1.21□□□□□ -2.6
PDR12Q02785 YBR051WYBR051W 351 nt-1.21□□□□□ -2.6
PDR12Q02785 YDL152WYDL152W 366 nt-1.22□□□□□ -2.6
PDR12Q02785 MMS21YEL019C 804 nt-1.22□□□□□ -2.6
PDR12Q02785 TDA2YER071C 381 nt-1.22□□□□□ -2.6
PDR12Q02785 BNS1YGR230W 414 nt-1.22□□□□□ -2.6
PDR12Q02785 MRPS8YMR158W 468 nt-1.22□□□□□ -2.6
PDR12Q02785 NUP82YJL061W 2142 nt-1.22□□□□□ -2.61
PDR12Q02785 LSO2YGR169C-A 279 nt-1.23□□□□□ -2.61
PDR12Q02785 GOS1YHL031C 672 nt-1.23□□□□□ -2.61
PDR12Q02785 YGR115CYGR115C 780 nt-1.25□□□□□ -2.61
PDR12Q02785 YKL115CYKL115C 393 nt-1.25□□□□□ -2.61
PDR12Q02785 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt-1.25□□□□□ -2.61
PDR12Q02785 YBR064WYBR064W 429 nt-1.25□□□□□ -2.61
PDR12Q02785 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt-1.25□□□□□ -2.61
PDR12Q02785 YDL068WYDL068W 330 nt-1.26□□□□□ -2.61
PDR12Q02785 snR44snR44 211 nt-1.26□□□□□ -2.61
PDR12Q02785 YLL032CYLL032C 2478 nt-1.27□□□□□ -2.61
PDR12Q02785 YJR079WYJR079W 330 nt-1.27□□□□□ -2.61
PDR12Q02785 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt-1.29□□□□□ -2.62
PDR12Q02785 YOR015WYOR015W 360 nt-1.29□□□□□ -2.62
PDR12Q02785 YOR248WYOR248W 303 nt-1.29□□□□□ -2.62
PDR12Q02785 ATC1YDR184C 885 nt-1.3□□□□□ -2.62
PDR12Q02785 YDR008CYDR008C 351 nt-1.3□□□□□ -2.62
PDR12Q02785 SMD2YLR275W 333 nt-1.3□□□□□ -2.62
PDR12Q02785 IPP1YBR011C 864 nt-1.3□□□□□ -2.62
PDR12Q02785 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt-1.31□□□□□ -2.62
PDR12Q02785 SEM1YDR363W-A 270 nt-1.32□□□□□ -2.62
PDR12Q02785 YLR287CYLR287C 1068 nt-1.32□□□□□ -2.62
PDR12Q02785 RPS25BYLR333C 327 nt-1.32□□□□□ -2.62
PDR12Q02785 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt-1.33□□□□□ -2.62
PDR12Q02785 MRPL31YKL138C 396 nt-1.33□□□□□ -2.62
PDR12Q02785 GRX5YPL059W 453 nt-1.33□□□□□ -2.62
PDR12Q02785 IRC2YDR112W 309 nt-1.35□□□□□ -2.62
PDR12Q02785 BLS1YLR408C 369 nt-1.35□□□□□ -2.62
PDR12Q02785 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt-1.35□□□□□ -2.62
PDR12Q02785 SUS1YBR111W-A 291 nt-1.35□□□□□ -2.62
PDR12Q02785 BI4Q0120 1917 nt-1.35□□□□□ -2.63
PDR12Q02785 PAA1YDR071C 576 nt-1.36□□□□□ -2.63
PDR12Q02785 YLR271WYLR271W 825 nt-1.36□□□□□ -2.63
PDR12Q02785 MFA2YNL145W 117 nt-1.36□□□□□ -2.63
PDR12Q02785 YNL319WYNL319W 441 nt-1.36□□□□□ -2.63
PDR12Q02785 SNU56YDR240C 1479 nt-1.37□□□□□ -2.63
PDR12Q02785 RUB1YDR139C 234 nt-1.37□□□□□ -2.63
PDR12Q02785 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt-1.37□□□□□ -2.63
PDR12Q02785 RPL29YFR032C-A 180 nt-1.38□□□□□ -2.63
PDR12Q02785 YML007C-AYML007C-A 111 nt-1.38□□□□□ -2.63
PDR12Q02785 UBS1YBR165W 834 nt-1.38□□□□□ -2.63
PDR12Q02785 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt-1.39□□□□□ -2.63
PDR12Q02785 ECL1YGR146C 636 nt-1.4□□□□□ -2.63
PDR12Q02785 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-1.4□□□□□ -2.63
PDR12Q02785 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt-1.4□□□□□ -2.63
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 6.9 ms