Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms