Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC6A3Q01959 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms