Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE1BQ01064 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE1BQ01064 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE1BQ01064 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE1BQ01064 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE1BQ01064 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE1BQ01064 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE1BQ01064 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE1BQ01064 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE1BQ01064 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE1BQ01064 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE1BQ01064 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE1BQ01064 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE1BQ01064 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE1BQ01064 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE1BQ01064 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE1BQ01064 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE1BQ01064 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE1BQ01064 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE1BQ01064 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE1BQ01064 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE1BQ01064 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE1BQ01064 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE1BQ01064 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE1BQ01064 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE1BQ01064 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms