Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MDM2Q00987 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms