Protein–RNA interactions for Protein: Q00889

PSG6, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 6, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG6Q00889 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSG6Q00889 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSG6Q00889 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms