Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPC5P78333 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPC5P78333 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPC5P78333 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPC5P78333 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPC5P78333 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPC5P78333 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPC5P78333 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPC5P78333 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPC5P78333 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPC5P78333 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPC5P78333 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPC5P78333 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPC5P78333 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPC5P78333 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPC5P78333 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPC5P78333 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPC5P78333 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPC5P78333 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPC5P78333 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPC5P78333 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPC5P78333 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPC5P78333 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPC5P78333 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPC5P78333 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPC5P78333 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPC5P78333 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPC5P78333 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPC5P78333 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPC5P78333 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC5P78333 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC5P78333 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC5P78333 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC5P78333 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC5P78333 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC5P78333 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC5P78333 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC5P78333 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC5P78333 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC5P78333 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC5P78333 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC5P78333 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC5P78333 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC5P78333 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC5P78333 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC5P78333 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC5P78333 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC5P78333 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC5P78333 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC5P78333 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC5P78333 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC5P78333 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC5P78333 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC5P78333 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC5P78333 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC5P78333 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC5P78333 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC5P78333 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC5P78333 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC5P78333 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC5P78333 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC5P78333 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC5P78333 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC5P78333 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC5P78333 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC5P78333 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC5P78333 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC5P78333 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC5P78333 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC5P78333 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC5P78333 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC5P78333 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC5P78333 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC5P78333 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC5P78333 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
GPC5P78333 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC5P78333 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC5P78333 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC5P78333 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC5P78333 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC5P78333 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC5P78333 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC5P78333 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC5P78333 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC5P78333 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC5P78333 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC5P78333 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC5P78333 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC5P78333 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC5P78333 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC5P78333 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC5P78333 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC5P78333 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC5P78333 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC5P78333 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC5P78333 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC5P78333 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPC5P78333 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPC5P78333 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPC5P78333 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
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