Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HERVK_113P62684 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms