Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms