Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRP1P56182 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRP1P56182 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRP1P56182 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRP1P56182 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRP1P56182 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRP1P56182 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRP1P56182 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRP1P56182 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RRP1P56182 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RRP1P56182 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RRP1P56182 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RRP1P56182 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RRP1P56182 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRP1P56182 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRP1P56182 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRP1P56182 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRP1P56182 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRP1P56182 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRP1P56182 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRP1P56182 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRP1P56182 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRP1P56182 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRP1P56182 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRP1P56182 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRP1P56182 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRP1P56182 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRP1P56182 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRP1P56182 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRP1P56182 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRP1P56182 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RRP1P56182 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRP1P56182 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRP1P56182 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRP1P56182 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRP1P56182 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRP1P56182 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRP1P56182 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RRP1P56182 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRP1P56182 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RRP1P56182 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRP1P56182 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRP1P56182 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRP1P56182 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRP1P56182 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRP1P56182 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRP1P56182 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRP1P56182 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRP1P56182 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRP1P56182 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRP1P56182 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RRP1P56182 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRP1P56182 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RRP1P56182 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRP1P56182 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRP1P56182 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRP1P56182 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRP1P56182 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RRP1P56182 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRP1P56182 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRP1P56182 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRP1P56182 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRP1P56182 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRP1P56182 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRP1P56182 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRP1P56182 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRP1P56182 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRP1P56182 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RRP1P56182 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RRP1P56182 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRP1P56182 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRP1P56182 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRP1P56182 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRP1P56182 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRP1P56182 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RRP1P56182 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRP1P56182 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRP1P56182 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRP1P56182 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RRP1P56182 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRP1P56182 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRP1P56182 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRP1P56182 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRP1P56182 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRP1P56182 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRP1P56182 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRP1P56182 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRP1P56182 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRP1P56182 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RRP1P56182 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRP1P56182 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRP1P56182 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRP1P56182 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRP1P56182 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRP1P56182 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRP1P56182 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRP1P56182 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRP1P56182 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRP1P56182 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRP1P56182 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms