Protein–RNA interactions for Protein: P54920

NAPA, Alpha-soluble NSF attachment protein, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAPAP54920 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NAPAP54920 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NAPAP54920 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NAPAP54920 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NAPAP54920 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NAPAP54920 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NAPAP54920 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NAPAP54920 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NAPAP54920 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NAPAP54920 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NAPAP54920 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NAPAP54920 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NAPAP54920 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAPAP54920 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAPAP54920 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAPAP54920 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAPAP54920 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAPAP54920 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAPAP54920 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAPAP54920 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAPAP54920 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAPAP54920 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAPAP54920 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NAPAP54920 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAPAP54920 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAPAP54920 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAPAP54920 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAPAP54920 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAPAP54920 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAPAP54920 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NAPAP54920 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAPAP54920 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAPAP54920 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAPAP54920 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NAPAP54920 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NAPAP54920 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NAPAP54920 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NAPAP54920 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NAPAP54920 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NAPAP54920 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NAPAP54920 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NAPAP54920 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NAPAP54920 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NAPAP54920 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NAPAP54920 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NAPAP54920 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NAPAP54920 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NAPAP54920 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NAPAP54920 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NAPAP54920 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NAPAP54920 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NAPAP54920 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NAPAP54920 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NAPAP54920 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NAPAP54920 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NAPAP54920 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NAPAP54920 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NAPAP54920 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NAPAP54920 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NAPAP54920 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NAPAP54920 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NAPAP54920 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NAPAP54920 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NAPAP54920 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NAPAP54920 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAPAP54920 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAPAP54920 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAPAP54920 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAPAP54920 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAPAP54920 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAPAP54920 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAPAP54920 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NAPAP54920 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAPAP54920 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAPAP54920 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAPAP54920 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAPAP54920 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NAPAP54920 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NAPAP54920 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAPAP54920 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAPAP54920 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAPAP54920 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAPAP54920 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAPAP54920 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAPAP54920 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAPAP54920 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAPAP54920 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAPAP54920 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAPAP54920 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAPAP54920 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAPAP54920 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAPAP54920 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAPAP54920 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAPAP54920 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAPAP54920 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAPAP54920 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAPAP54920 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAPAP54920 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NAPAP54920 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAPAP54920 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms