Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP12AP54707 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms