Protein–RNA interactions for Protein: P53830

CUS2, Cold sensitive U2 snRNA suppressor 2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CUS2P53830 MMS4YBR098W 2076 nt0.66□□□□□ -2.3
CUS2P53830 YGL239CYGL239C 315 nt0.65□□□□□ -2.31
CUS2P53830 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.65□□□□□ -2.31
CUS2P53830 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.65□□□□□ -2.31
CUS2P53830 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.65□□□□□ -2.31
CUS2P53830 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.65□□□□□ -2.31
CUS2P53830 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.65□□□□□ -2.31
CUS2P53830 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.65□□□□□ -2.31
CUS2P53830 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.65□□□□□ -2.31
CUS2P53830 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.65□□□□□ -2.31
CUS2P53830 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.65□□□□□ -2.31
CUS2P53830 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.65□□□□□ -2.31
CUS2P53830 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.65□□□□□ -2.31
CUS2P53830 STE18YJR086W 333 nt0.65□□□□□ -2.31
CUS2P53830 NFU1YKL040C 771 nt0.65□□□□□ -2.31
CUS2P53830 PBI2YNL015W 228 nt0.65□□□□□ -2.31
CUS2P53830 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt0.65□□□□□ -2.31
CUS2P53830 SWI6YLR182W 2412 nt0.65□□□□□ -2.31
CUS2P53830 UBP3YER151C 2739 nt0.65□□□□□ -2.31
CUS2P53830 SWF1YDR126W 1011 nt0.64□□□□□ -2.31
CUS2P53830 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.64□□□□□ -2.31
CUS2P53830 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.64□□□□□ -2.31
CUS2P53830 EAF6YJR082C 342 nt0.64□□□□□ -2.31
CUS2P53830 AIM29YKR074W 468 nt0.64□□□□□ -2.31
CUS2P53830 UPS1YLR193C 528 nt0.64□□□□□ -2.31
CUS2P53830 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.64□□□□□ -2.31
CUS2P53830 RFX1YLR176C 2436 nt0.64□□□□□ -2.31
CUS2P53830 SLY1YDR189W 2001 nt0.64□□□□□ -2.31
CUS2P53830 APL2YKL135C 2181 nt0.63□□□□□ -2.31
CUS2P53830 WIP1YDR374W-A 270 nt0.63□□□□□ -2.31
CUS2P53830 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.63□□□□□ -2.31
CUS2P53830 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.63□□□□□ -2.31
CUS2P53830 LCD1YDR499W 2244 nt0.62□□□□□ -2.31
CUS2P53830 YDR269CYDR269C 324 nt0.62□□□□□ -2.31
CUS2P53830 PRE4YFR050C 801 nt0.62□□□□□ -2.31
CUS2P53830 YGR042WYGR042W 816 nt0.62□□□□□ -2.31
CUS2P53830 BIG1YHR101C 1008 nt0.62□□□□□ -2.31
CUS2P53830 ALG13YGL047W 609 nt0.61□□□□□ -2.31
CUS2P53830 NPC2YDL046W 522 nt0.6□□□□□ -2.31
CUS2P53830 YGR290WYGR290W 444 nt0.6□□□□□ -2.31
CUS2P53830 YIL059CYIL059C 366 nt0.6□□□□□ -2.31
CUS2P53830 YML108WYML108W 318 nt0.6□□□□□ -2.31
CUS2P53830 RRT1YBL048W 312 nt0.6□□□□□ -2.31
CUS2P53830 IES4YOR189W 351 nt0.6□□□□□ -2.31
CUS2P53830 snR72snR72 98 nt0.59□□□□□ -2.31
CUS2P53830 FYV7YLR068W 456 nt0.59□□□□□ -2.31
CUS2P53830 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.58□□□□□ -2.32
CUS2P53830 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.58□□□□□ -2.32
CUS2P53830 YJL135WYJL135W 318 nt0.58□□□□□ -2.32
CUS2P53830 RPB10YOR210W 213 nt0.58□□□□□ -2.32
CUS2P53830 YPR153WYPR153W 423 nt0.58□□□□□ -2.32
CUS2P53830 WAR1YML076C 2835 nt0.58□□□□□ -2.32
CUS2P53830 EFR3YMR212C 2349 nt0.58□□□□□ -2.32
CUS2P53830 YJR003CYJR003C 1560 nt0.57□□□□□ -2.32
CUS2P53830 COG4YPR105C 2586 nt0.57□□□□□ -2.32
CUS2P53830 DBP6YNR038W 1890 nt0.57□□□□□ -2.32
CUS2P53830 ZIP2YGL249W 2115 nt0.57□□□□□ -2.32
CUS2P53830 TIM13YGR181W 318 nt0.57□□□□□ -2.32
CUS2P53830 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.57□□□□□ -2.32
CUS2P53830 YBL071CYBL071C 309 nt0.57□□□□□ -2.32
CUS2P53830 SLI15YBR156C 2097 nt0.57□□□□□ -2.32
CUS2P53830 UTP10YJL109C 5310 nt0.56□□□□□ -2.32
CUS2P53830 YDL158CYDL158C 309 nt0.56□□□□□ -2.32
CUS2P53830 RPS27AYKL156W 249 nt0.56□□□□□ -2.32
CUS2P53830 RPL38YLR325C 237 nt0.56□□□□□ -2.32
CUS2P53830 YHL041WYHL041W 450 nt0.55□□□□□ -2.32
CUS2P53830 ECM12YHR021W-A 456 nt0.55□□□□□ -2.32
CUS2P53830 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.55□□□□□ -2.32
CUS2P53830 YHR125WYHR125W 306 nt0.55□□□□□ -2.32
CUS2P53830 TOM22YNL131W 459 nt0.55□□□□□ -2.32
CUS2P53830 YLL007CYLL007C 1998 nt0.55□□□□□ -2.32
CUS2P53830 ISD11YER048W-A 285 nt0.54□□□□□ -2.32
CUS2P53830 ZEO1YOL109W 342 nt0.54□□□□□ -2.32
CUS2P53830 YPL182CYPL182C 384 nt0.54□□□□□ -2.32
CUS2P53830 YML002WYML002W 2214 nt0.54□□□□□ -2.32
CUS2P53830 BFR2YDR299W 1605 nt0.53□□□□□ -2.32
CUS2P53830 LTE1YAL024C 4308 nt0.53□□□□□ -2.32
CUS2P53830 YDR344CYDR344C 444 nt0.53□□□□□ -2.32
CUS2P53830 BI2Q0110 1272 nt0.53□□□□□ -2.32
CUS2P53830 YLR287CYLR287C 1068 nt0.53□□□□□ -2.32
CUS2P53830 YNL122CYNL122C 348 nt0.53□□□□□ -2.32
CUS2P53830 snR41snR41 95 nt0.53□□□□□ -2.32
CUS2P53830 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt0.52□□□□□ -2.33
CUS2P53830 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.52□□□□□ -2.33
CUS2P53830 INA22YIR024C 651 nt0.51□□□□□ -2.33
CUS2P53830 PKH2YOL100W 3246 nt0.51□□□□□ -2.33
CUS2P53830 snR51snR51 107 nt0.51□□□□□ -2.33
CUS2P53830 PAN2YGL094C 3348 nt0.51□□□□□ -2.33
CUS2P53830 YDL011CYDL011C 324 nt0.5□□□□□ -2.33
CUS2P53830 CBS1YDL069C 690 nt0.5□□□□□ -2.33
CUS2P53830 RPL26AYLR344W 384 nt0.5□□□□□ -2.33
CUS2P53830 YSP1YHR155W 3687 nt0.49□□□□□ -2.33
CUS2P53830 OST1YJL002C 1431 nt0.49□□□□□ -2.33
CUS2P53830 SDH7YDR511W 402 nt0.49□□□□□ -2.33
CUS2P53830 GPG1YGL121C 381 nt0.49□□□□□ -2.33
CUS2P53830 YKL083WYKL083W 615 nt0.49□□□□□ -2.33
CUS2P53830 UBC7YMR022W 498 nt0.49□□□□□ -2.33
CUS2P53830 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.49□□□□□ -2.33
CUS2P53830 PAC1YOR269W 1485 nt0.48□□□□□ -2.33
CUS2P53830 YHR130CYHR130C 336 nt0.48□□□□□ -2.33
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