Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP11P51784 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP11P51784 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP11P51784 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP11P51784 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP11P51784 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP11P51784 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP11P51784 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP11P51784 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP11P51784 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP11P51784 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP11P51784 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP11P51784 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP11P51784 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP11P51784 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP11P51784 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP11P51784 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP11P51784 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP11P51784 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP11P51784 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP11P51784 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP11P51784 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP11P51784 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP11P51784 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
USP11P51784 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
USP11P51784 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
USP11P51784 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP11P51784 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP11P51784 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP11P51784 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP11P51784 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP11P51784 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP11P51784 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP11P51784 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP11P51784 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP11P51784 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP11P51784 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP11P51784 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP11P51784 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP11P51784 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP11P51784 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP11P51784 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP11P51784 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP11P51784 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP11P51784 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP11P51784 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP11P51784 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP11P51784 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP11P51784 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP11P51784 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP11P51784 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP11P51784 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP11P51784 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP11P51784 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP11P51784 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP11P51784 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP11P51784 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP11P51784 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP11P51784 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP11P51784 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP11P51784 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP11P51784 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP11P51784 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP11P51784 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP11P51784 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP11P51784 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP11P51784 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP11P51784 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP11P51784 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP11P51784 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP11P51784 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP11P51784 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP11P51784 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP11P51784 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP11P51784 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP11P51784 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP11P51784 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP11P51784 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP11P51784 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP11P51784 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP11P51784 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP11P51784 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP11P51784 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP11P51784 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP11P51784 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP11P51784 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP11P51784 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP11P51784 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP11P51784 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP11P51784 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP11P51784 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP11P51784 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP11P51784 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP11P51784 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP11P51784 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP11P51784 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP11P51784 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP11P51784 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP11P51784 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP11P51784 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms