Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPFP49454 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPFP49454 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPFP49454 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPFP49454 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPFP49454 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPFP49454 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPFP49454 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPFP49454 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPFP49454 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPFP49454 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPFP49454 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPFP49454 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPFP49454 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPFP49454 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPFP49454 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPFP49454 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPFP49454 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPFP49454 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPFP49454 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPFP49454 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPFP49454 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPFP49454 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPFP49454 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPFP49454 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPFP49454 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPFP49454 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPFP49454 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPFP49454 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPFP49454 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPFP49454 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPFP49454 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPFP49454 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPFP49454 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPFP49454 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPFP49454 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPFP49454 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPFP49454 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPFP49454 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPFP49454 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPFP49454 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPFP49454 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPFP49454 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPFP49454 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPFP49454 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPFP49454 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPFP49454 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPFP49454 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPFP49454 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPFP49454 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPFP49454 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPFP49454 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPFP49454 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPFP49454 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPFP49454 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPFP49454 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPFP49454 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPFP49454 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPFP49454 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPFP49454 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPFP49454 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPFP49454 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPFP49454 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPFP49454 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPFP49454 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPFP49454 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPFP49454 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPFP49454 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPFP49454 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPFP49454 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPFP49454 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPFP49454 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPFP49454 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPFP49454 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPFP49454 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPFP49454 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPFP49454 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPFP49454 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPFP49454 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPFP49454 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPFP49454 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPFP49454 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPFP49454 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPFP49454 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPFP49454 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPFP49454 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPFP49454 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPFP49454 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPFP49454 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPFP49454 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPFP49454 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CENPFP49454 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CENPFP49454 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CENPFP49454 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CENPFP49454 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CENPFP49454 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CENPFP49454 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CENPFP49454 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CENPFP49454 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPFP49454 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms