Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC32.38■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RANGAP1P46060 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms