Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP5P45974 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP5P45974 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP5P45974 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP5P45974 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP5P45974 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP5P45974 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP5P45974 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP5P45974 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP5P45974 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP5P45974 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP5P45974 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP5P45974 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP5P45974 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP5P45974 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP5P45974 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP5P45974 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP5P45974 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP5P45974 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP5P45974 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP5P45974 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP5P45974 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP5P45974 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP5P45974 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP5P45974 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP5P45974 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP5P45974 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP5P45974 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP5P45974 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP5P45974 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP5P45974 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP5P45974 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP5P45974 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP5P45974 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP5P45974 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP5P45974 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP5P45974 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP5P45974 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP5P45974 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP5P45974 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP5P45974 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP5P45974 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
USP5P45974 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP5P45974 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP5P45974 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP5P45974 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP5P45974 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP5P45974 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP5P45974 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP5P45974 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP5P45974 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP5P45974 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP5P45974 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP5P45974 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP5P45974 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP5P45974 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP5P45974 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP5P45974 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
USP5P45974 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP5P45974 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP5P45974 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP5P45974 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP5P45974 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP5P45974 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP5P45974 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP5P45974 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP5P45974 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP5P45974 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP5P45974 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP5P45974 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP5P45974 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP5P45974 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP5P45974 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP5P45974 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP5P45974 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP5P45974 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
USP5P45974 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24■■□□□ 1.43
USP5P45974 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP5P45974 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP5P45974 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP5P45974 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP5P45974 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP5P45974 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP5P45974 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP5P45974 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
USP5P45974 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP5P45974 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
USP5P45974 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP5P45974 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP5P45974 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP5P45974 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP5P45974 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP5P45974 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP5P45974 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP5P45974 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP5P45974 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP5P45974 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP5P45974 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP5P45974 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP5P45974 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms