Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SSR1P43307 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SSR1P43307 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SSR1P43307 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SSR1P43307 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SSR1P43307 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SSR1P43307 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SSR1P43307 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSR1P43307 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SSR1P43307 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSR1P43307 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SSR1P43307 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSR1P43307 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SSR1P43307 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SSR1P43307 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SSR1P43307 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SSR1P43307 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SSR1P43307 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SSR1P43307 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SSR1P43307 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SSR1P43307 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SSR1P43307 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSR1P43307 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSR1P43307 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSR1P43307 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSR1P43307 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSR1P43307 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SSR1P43307 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSR1P43307 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSR1P43307 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SSR1P43307 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SSR1P43307 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSR1P43307 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SSR1P43307 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SSR1P43307 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSR1P43307 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSR1P43307 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSR1P43307 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SSR1P43307 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SSR1P43307 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSR1P43307 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SSR1P43307 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSR1P43307 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SSR1P43307 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SSR1P43307 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SSR1P43307 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SSR1P43307 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SSR1P43307 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SSR1P43307 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSR1P43307 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SSR1P43307 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSR1P43307 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SSR1P43307 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSR1P43307 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSR1P43307 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SSR1P43307 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSR1P43307 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSR1P43307 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSR1P43307 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SSR1P43307 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SSR1P43307 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSR1P43307 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSR1P43307 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SSR1P43307 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSR1P43307 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SSR1P43307 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSR1P43307 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSR1P43307 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSR1P43307 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSR1P43307 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSR1P43307 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSR1P43307 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SSR1P43307 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SSR1P43307 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSR1P43307 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSR1P43307 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSR1P43307 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSR1P43307 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSR1P43307 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSR1P43307 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSR1P43307 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SSR1P43307 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SSR1P43307 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SSR1P43307 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSR1P43307 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SSR1P43307 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SSR1P43307 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSR1P43307 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SSR1P43307 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSR1P43307 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSR1P43307 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SSR1P43307 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SSR1P43307 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SSR1P43307 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSR1P43307 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSR1P43307 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSR1P43307 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSR1P43307 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSR1P43307 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SSR1P43307 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms