Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCAMP43121 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCAMP43121 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCAMP43121 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCAMP43121 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCAMP43121 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCAMP43121 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCAMP43121 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCAMP43121 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCAMP43121 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCAMP43121 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCAMP43121 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCAMP43121 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCAMP43121 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCAMP43121 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCAMP43121 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCAMP43121 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCAMP43121 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCAMP43121 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MCAMP43121 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCAMP43121 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCAMP43121 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCAMP43121 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCAMP43121 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCAMP43121 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCAMP43121 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MCAMP43121 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCAMP43121 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCAMP43121 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCAMP43121 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCAMP43121 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCAMP43121 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCAMP43121 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCAMP43121 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCAMP43121 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCAMP43121 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCAMP43121 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCAMP43121 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCAMP43121 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCAMP43121 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCAMP43121 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MCAMP43121 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCAMP43121 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCAMP43121 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCAMP43121 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCAMP43121 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCAMP43121 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCAMP43121 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCAMP43121 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCAMP43121 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCAMP43121 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCAMP43121 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCAMP43121 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCAMP43121 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MCAMP43121 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MCAMP43121 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCAMP43121 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCAMP43121 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCAMP43121 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCAMP43121 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MCAMP43121 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCAMP43121 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCAMP43121 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCAMP43121 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCAMP43121 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCAMP43121 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCAMP43121 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCAMP43121 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCAMP43121 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCAMP43121 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCAMP43121 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCAMP43121 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCAMP43121 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCAMP43121 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCAMP43121 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCAMP43121 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MCAMP43121 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MCAMP43121 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MCAMP43121 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCAMP43121 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCAMP43121 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCAMP43121 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCAMP43121 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCAMP43121 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCAMP43121 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCAMP43121 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCAMP43121 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MCAMP43121 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCAMP43121 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCAMP43121 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCAMP43121 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCAMP43121 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCAMP43121 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCAMP43121 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCAMP43121 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCAMP43121 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCAMP43121 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCAMP43121 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCAMP43121 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCAMP43121 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms