Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms