Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MLH1P40692 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MLH1P40692 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MLH1P40692 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MLH1P40692 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MLH1P40692 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MLH1P40692 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MLH1P40692 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MLH1P40692 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MLH1P40692 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MLH1P40692 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MLH1P40692 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MLH1P40692 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MLH1P40692 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MLH1P40692 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MLH1P40692 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MLH1P40692 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MLH1P40692 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MLH1P40692 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MLH1P40692 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MLH1P40692 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MLH1P40692 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MLH1P40692 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MLH1P40692 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MLH1P40692 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MLH1P40692 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MLH1P40692 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MLH1P40692 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MLH1P40692 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MLH1P40692 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MLH1P40692 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MLH1P40692 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MLH1P40692 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MLH1P40692 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MLH1P40692 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MLH1P40692 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MLH1P40692 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MLH1P40692 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MLH1P40692 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MLH1P40692 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MLH1P40692 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MLH1P40692 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MLH1P40692 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MLH1P40692 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MLH1P40692 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MLH1P40692 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MLH1P40692 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MLH1P40692 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MLH1P40692 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MLH1P40692 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MLH1P40692 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MLH1P40692 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MLH1P40692 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MLH1P40692 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MLH1P40692 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MLH1P40692 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MLH1P40692 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MLH1P40692 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MLH1P40692 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MLH1P40692 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MLH1P40692 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MLH1P40692 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MLH1P40692 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MLH1P40692 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MLH1P40692 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MLH1P40692 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MLH1P40692 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MLH1P40692 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MLH1P40692 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MLH1P40692 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MLH1P40692 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MLH1P40692 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MLH1P40692 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MLH1P40692 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MLH1P40692 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MLH1P40692 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MLH1P40692 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MLH1P40692 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MLH1P40692 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MLH1P40692 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MLH1P40692 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MLH1P40692 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MLH1P40692 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MLH1P40692 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MLH1P40692 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MLH1P40692 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MLH1P40692 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MLH1P40692 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MLH1P40692 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MLH1P40692 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MLH1P40692 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MLH1P40692 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MLH1P40692 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MLH1P40692 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MLH1P40692 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MLH1P40692 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MLH1P40692 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MLH1P40692 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MLH1P40692 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MLH1P40692 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms