Protein–RNA interactions for Protein: P40550

PDR11, ATP-dependent permease PDR11, yeastyeast

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Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR11P40550 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt-0.46□□□□□ -2.48
PDR11P40550 VPS63YLR261C 327 nt-0.46□□□□□ -2.48
PDR11P40550 YNL150WYNL150W 408 nt-0.46□□□□□ -2.48
PDR11P40550 CSM4YPL200W 471 nt-0.46□□□□□ -2.48
PDR11P40550 TDA2YER071C 381 nt-0.47□□□□□ -2.48
PDR11P40550 RAD61YDR014W 1944 nt-0.47□□□□□ -2.49
PDR11P40550 SEC10YLR166C 2616 nt-0.48□□□□□ -2.49
PDR11P40550 CUL3YGR003W 2235 nt-0.48□□□□□ -2.49
PDR11P40550 YDR344CYDR344C 444 nt-0.48□□□□□ -2.49
PDR11P40550 MMS21YEL019C 804 nt-0.48□□□□□ -2.49
PDR11P40550 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt-0.48□□□□□ -2.49
PDR11P40550 YNR077CYNR077C 255 nt-0.48□□□□□ -2.49
PDR11P40550 YPL225WYPL225W 441 nt-0.48□□□□□ -2.49
PDR11P40550 YCL002CYCL002C 792 nt-0.49□□□□□ -2.49
PDR11P40550 EFR3YMR212C 2349 nt-0.5□□□□□ -2.49
PDR11P40550 NPC2YDL046W 522 nt-0.5□□□□□ -2.49
PDR11P40550 YDL187CYDL187C 330 nt-0.5□□□□□ -2.49
PDR11P40550 SBH2YER019C-A 267 nt-0.5□□□□□ -2.49
PDR11P40550 CDC33YOL139C 642 nt-0.5□□□□□ -2.49
PDR11P40550 ORC3YLL004W 1851 nt-0.5□□□□□ -2.49
PDR11P40550 YDR008CYDR008C 351 nt-0.51□□□□□ -2.49
PDR11P40550 YLL032CYLL032C 2478 nt-0.51□□□□□ -2.49
PDR11P40550 SOV1YMR066W 2697 nt-0.52□□□□□ -2.49
PDR11P40550 snR8snR8 190 nt-0.52□□□□□ -2.49
PDR11P40550 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt-0.52□□□□□ -2.49
PDR11P40550 TIM10YHR005C-A 282 nt-0.52□□□□□ -2.49
PDR11P40550 COX5BYIL111W 456 nt-0.53□□□□□ -2.49
PDR11P40550 BLS1YLR408C 369 nt-0.53□□□□□ -2.49
PDR11P40550 snR79snR79 84 nt-0.54□□□□□ -2.5
PDR11P40550 YER038W-AYER038W-A 381 nt-0.54□□□□□ -2.5
PDR11P40550 YPL044CYPL044C 549 nt-0.54□□□□□ -2.5
PDR11P40550 YPR099CYPR099C 357 nt-0.54□□□□□ -2.5
PDR11P40550 SUS1YBR111W-A 291 nt-0.54□□□□□ -2.5
PDR11P40550 DAD1YDR016C 285 nt-0.55□□□□□ -2.5
PDR11P40550 MRPL31YKL138C 396 nt-0.55□□□□□ -2.5
PDR11P40550 TFB6YOR352W 1032 nt-0.55□□□□□ -2.5
PDR11P40550 YPL185WYPL185W 396 nt-0.55□□□□□ -2.5
PDR11P40550 PAN3YKL025C 2040 nt-0.55□□□□□ -2.5
PDR11P40550 DFG10YIL049W 762 nt-0.55□□□□□ -2.5
PDR11P40550 AFB1YLR040C 675 nt-0.55□□□□□ -2.5
PDR11P40550 GSP1YLR293C 660 nt-0.55□□□□□ -2.5
PDR11P40550 YER158W-AYER158W-A 216 nt-0.56□□□□□ -2.5
PDR11P40550 YFR057WYFR057W 456 nt-0.56□□□□□ -2.5
PDR11P40550 YEL073CYEL073C 324 nt-0.57□□□□□ -2.5
PDR11P40550 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt-0.57□□□□□ -2.5
PDR11P40550 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt-0.57□□□□□ -2.5
PDR11P40550 YBR206WYBR206W 324 nt-0.58□□□□□ -2.5
PDR11P40550 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt-0.58□□□□□ -2.5
PDR11P40550 RPS26AYGL189C 360 nt-0.59□□□□□ -2.5
PDR11P40550 YJR011CYJR011C 786 nt-0.59□□□□□ -2.5
PDR11P40550 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt-0.59□□□□□ -2.5
PDR11P40550 YNL211CYNL211C 261 nt-0.59□□□□□ -2.5
PDR11P40550 LEE1YPL054W 906 nt-0.59□□□□□ -2.5
PDR11P40550 OST4YDL232W 111 nt-0.6□□□□□ -2.51
PDR11P40550 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt-0.6□□□□□ -2.51
PDR11P40550 GIM5YML094W 492 nt-0.6□□□□□ -2.51
PDR11P40550 ATC1YDR184C 885 nt-0.61□□□□□ -2.51
PDR11P40550 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt-0.61□□□□□ -2.51
PDR11P40550 YLR101CYLR101C 396 nt-0.61□□□□□ -2.51
PDR11P40550 BI4Q0120 1917 nt-0.62□□□□□ -2.51
PDR11P40550 RPM2YML091C 3609 nt-0.62□□□□□ -2.51
PDR11P40550 PRP21YJL203W 843 nt-0.62□□□□□ -2.51
PDR11P40550 snR128snR128 126 nt-0.62□□□□□ -2.51
PDR11P40550 RFX1YLR176C 2436 nt-0.63□□□□□ -2.51
PDR11P40550 QCR7YDR529C 384 nt-0.63□□□□□ -2.51
PDR11P40550 YJR079WYJR079W 330 nt-0.64□□□□□ -2.51
PDR11P40550 ECM9YKR004C 1134 nt-0.64□□□□□ -2.51
PDR11P40550 snR59snR59 78 nt-0.64□□□□□ -2.51
PDR11P40550 IRC2YDR112W 309 nt-0.64□□□□□ -2.51
PDR11P40550 YOR366WYOR366W 354 nt-0.64□□□□□ -2.51
PDR11P40550 YER076W-AYER076W-A 348 nt-0.65□□□□□ -2.51
PDR11P40550 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt-0.65□□□□□ -2.51
PDR11P40550 MAM33YIL070C 801 nt-0.65□□□□□ -2.51
PDR11P40550 PSF2YJL072C 642 nt-0.65□□□□□ -2.51
PDR11P40550 YLR271WYLR271W 825 nt-0.65□□□□□ -2.51
PDR11P40550 ASE1YOR058C 2658 nt-0.66□□□□□ -2.52
PDR11P40550 OLI1Q0130 231 nt-0.66□□□□□ -2.52
PDR11P40550 YOL106WYOL106W 354 nt-0.66□□□□□ -2.52
PDR11P40550 IRC13YOR235W 315 nt-0.66□□□□□ -2.52
PDR11P40550 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt-0.66□□□□□ -2.52
PDR11P40550 ZIP2YGL249W 2115 nt-0.67□□□□□ -2.52
PDR11P40550 RMD6YEL072W 696 nt-0.67□□□□□ -2.52
PDR11P40550 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt-0.67□□□□□ -2.52
PDR11P40550 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.68□□□□□ -2.52
PDR11P40550 RUB1YDR139C 234 nt-0.68□□□□□ -2.52
PDR11P40550 GPX1YKL026C 504 nt-0.68□□□□□ -2.52
PDR11P40550 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt-0.68□□□□□ -2.52
PDR11P40550 YKU70YMR284W 1809 nt-0.68□□□□□ -2.52
PDR11P40550 NFU1YKL040C 771 nt-0.69□□□□□ -2.52
PDR11P40550 SDS22YKL193C 1017 nt-0.69□□□□□ -2.52
PDR11P40550 YNL146WYNL146W 303 nt-0.69□□□□□ -2.52
PDR11P40550 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt-0.7□□□□□ -2.52
PDR11P40550 YER138W-AYER138W-A 105 nt-0.71□□□□□ -2.52
PDR11P40550 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt-0.71□□□□□ -2.52
PDR11P40550 MYO1YHR023W 5787 nt-0.71□□□□□ -2.52
PDR11P40550 MCM10YIL150C 1716 nt-0.71□□□□□ -2.52
PDR11P40550 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt-0.72□□□□□ -2.52
PDR11P40550 COX7YMR256C 183 nt-0.72□□□□□ -2.52
PDR11P40550 YBR064WYBR064W 429 nt-0.72□□□□□ -2.52
PDR11P40550 HTB1YDR224C 396 nt-0.72□□□□□ -2.53
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