Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms