Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5C1P36542 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms