Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms