Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCD3P28288 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ABCD3P28288 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCD3P28288 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCD3P28288 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCD3P28288 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCD3P28288 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCD3P28288 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCD3P28288 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCD3P28288 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCD3P28288 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCD3P28288 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCD3P28288 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCD3P28288 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCD3P28288 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCD3P28288 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCD3P28288 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCD3P28288 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCD3P28288 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCD3P28288 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCD3P28288 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCD3P28288 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCD3P28288 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCD3P28288 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCD3P28288 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCD3P28288 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCD3P28288 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCD3P28288 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCD3P28288 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCD3P28288 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCD3P28288 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCD3P28288 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCD3P28288 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCD3P28288 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCD3P28288 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms