Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTPRGP23470 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
PTPRGP23470 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
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