Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGA6P23229 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA6P23229 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms