Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCP20941 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCP20941 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCP20941 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCP20941 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCP20941 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCP20941 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCP20941 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCP20941 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCP20941 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCP20941 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCP20941 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCP20941 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCP20941 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCP20941 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCP20941 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCP20941 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCP20941 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCP20941 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCP20941 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCP20941 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCP20941 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCP20941 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCP20941 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDCP20941 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDCP20941 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDCP20941 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDCP20941 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDCP20941 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDCP20941 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDCP20941 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PDCP20941 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDCP20941 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PDCP20941 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDCP20941 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDCP20941 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PDCP20941 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PDCP20941 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDCP20941 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDCP20941 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCP20941 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCP20941 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCP20941 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCP20941 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCP20941 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCP20941 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCP20941 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCP20941 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCP20941 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCP20941 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCP20941 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCP20941 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCP20941 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCP20941 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCP20941 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCP20941 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCP20941 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCP20941 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCP20941 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCP20941 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCP20941 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCP20941 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCP20941 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCP20941 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCP20941 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCP20941 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCP20941 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCP20941 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCP20941 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCP20941 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCP20941 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCP20941 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCP20941 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCP20941 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCP20941 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCP20941 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCP20941 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCP20941 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCP20941 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCP20941 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCP20941 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCP20941 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCP20941 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCP20941 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCP20941 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCP20941 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCP20941 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCP20941 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCP20941 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCP20941 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCP20941 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCP20941 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCP20941 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCP20941 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCP20941 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCP20941 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCP20941 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCP20941 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCP20941 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCP20941 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms