Protein–RNA interactions for Protein: P15822

HIVEP1, Zinc finger protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 2,718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP1P15822 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIVEP1P15822 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIVEP1P15822 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms