Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC130P13994 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC130P13994 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC130P13994 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC130P13994 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC130P13994 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC130P13994 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC130P13994 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC130P13994 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC130P13994 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC130P13994 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC130P13994 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC130P13994 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC130P13994 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC130P13994 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC130P13994 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC130P13994 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC130P13994 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC130P13994 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC130P13994 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC130P13994 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC130P13994 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC130P13994 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC130P13994 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC130P13994 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC130P13994 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC130P13994 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC130P13994 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC130P13994 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC130P13994 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC130P13994 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC130P13994 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC130P13994 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC130P13994 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC130P13994 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC130P13994 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC130P13994 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC130P13994 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC130P13994 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC130P13994 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC130P13994 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC130P13994 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC130P13994 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC130P13994 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC130P13994 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC130P13994 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC130P13994 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC130P13994 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC130P13994 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC130P13994 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC130P13994 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC130P13994 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC130P13994 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC130P13994 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC130P13994 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC130P13994 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC130P13994 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC130P13994 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC130P13994 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC130P13994 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC130P13994 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC130P13994 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC130P13994 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC130P13994 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC130P13994 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC130P13994 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC130P13994 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC130P13994 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC130P13994 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC130P13994 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC130P13994 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC130P13994 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC130P13994 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC130P13994 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC130P13994 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC130P13994 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC130P13994 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC130P13994 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC130P13994 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC130P13994 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC130P13994 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC130P13994 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC130P13994 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC130P13994 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC130P13994 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC130P13994 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC130P13994 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC130P13994 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC130P13994 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC130P13994 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC130P13994 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC130P13994 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC130P13994 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC130P13994 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC130P13994 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC130P13994 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC130P13994 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC130P13994 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC130P13994 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC130P13994 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms