Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms