Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.1 ms