Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHGAP10645 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHGAP10645 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHGAP10645 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHGAP10645 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHGAP10645 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHGAP10645 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHGAP10645 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CHGAP10645 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CHGAP10645 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CHGAP10645 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHGAP10645 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHGAP10645 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHGAP10645 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHGAP10645 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHGAP10645 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHGAP10645 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHGAP10645 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHGAP10645 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHGAP10645 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHGAP10645 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CHGAP10645 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHGAP10645 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHGAP10645 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHGAP10645 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHGAP10645 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHGAP10645 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHGAP10645 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHGAP10645 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHGAP10645 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHGAP10645 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHGAP10645 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHGAP10645 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHGAP10645 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CHGAP10645 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHGAP10645 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CHGAP10645 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHGAP10645 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHGAP10645 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CHGAP10645 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHGAP10645 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHGAP10645 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHGAP10645 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHGAP10645 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHGAP10645 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHGAP10645 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHGAP10645 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHGAP10645 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CHGAP10645 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHGAP10645 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHGAP10645 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHGAP10645 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHGAP10645 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHGAP10645 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHGAP10645 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHGAP10645 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHGAP10645 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHGAP10645 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHGAP10645 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHGAP10645 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CHGAP10645 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHGAP10645 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHGAP10645 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHGAP10645 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHGAP10645 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHGAP10645 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHGAP10645 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHGAP10645 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHGAP10645 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHGAP10645 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CHGAP10645 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHGAP10645 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHGAP10645 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHGAP10645 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHGAP10645 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHGAP10645 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHGAP10645 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHGAP10645 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHGAP10645 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHGAP10645 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHGAP10645 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHGAP10645 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHGAP10645 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHGAP10645 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CHGAP10645 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHGAP10645 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHGAP10645 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHGAP10645 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CHGAP10645 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHGAP10645 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHGAP10645 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CHGAP10645 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHGAP10645 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CHGAP10645 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CHGAP10645 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CHGAP10645 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CHGAP10645 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CHGAP10645 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CHGAP10645 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CHGAP10645 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms