Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RGPD1P0DJD0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RGPD1P0DJD0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RGPD1P0DJD0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RGPD1P0DJD0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RGPD1P0DJD0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RGPD1P0DJD0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RGPD1P0DJD0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RGPD1P0DJD0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RGPD1P0DJD0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD1P0DJD0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD1P0DJD0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD1P0DJD0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD1P0DJD0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD1P0DJD0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD1P0DJD0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD1P0DJD0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD1P0DJD0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD1P0DJD0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD1P0DJD0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD1P0DJD0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD1P0DJD0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD1P0DJD0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD1P0DJD0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD1P0DJD0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD1P0DJD0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD1P0DJD0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD1P0DJD0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD1P0DJD0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RGPD1P0DJD0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms