Protein–RNA interactions for Protein: P0CX38

RPS6B, 40S ribosomal protein S6-B, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPS6BP0CX38 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.9□□□□□ -1.95
RPS6BP0CX38 PBY1YBR094W 2262 nt2.9□□□□□ -1.95
RPS6BP0CX38 ZIP1YDR285W 2628 nt2.89□□□□□ -1.95
RPS6BP0CX38 ENV11YGR071C 2583 nt2.89□□□□□ -1.95
RPS6BP0CX38 snR61snR61 90 nt2.89□□□□□ -1.95
RPS6BP0CX38 CAT2YML042W 2013 nt2.89□□□□□ -1.95
RPS6BP0CX38 HSH155YMR288W 2916 nt2.89□□□□□ -1.95
RPS6BP0CX38 FRE2YKL220C 2136 nt2.89□□□□□ -1.95
RPS6BP0CX38 SLD3YGL113W 2007 nt2.88□□□□□ -1.95
RPS6BP0CX38 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
RPS6BP0CX38 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
RPS6BP0CX38 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
RPS6BP0CX38 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
RPS6BP0CX38 YER138CYER138C 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
RPS6BP0CX38 YER160CYER160C 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
RPS6BP0CX38 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
RPS6BP0CX38 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
RPS6BP0CX38 YJR027WYJR027W 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
RPS6BP0CX38 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
RPS6BP0CX38 YML039WYML039W 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
RPS6BP0CX38 YML045WYML045W 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
RPS6BP0CX38 YMR050CYMR050C 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
RPS6BP0CX38 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
RPS6BP0CX38 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.88□□□□□ -1.95
RPS6BP0CX38 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
RPS6BP0CX38 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
RPS6BP0CX38 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.88□□□□□ -1.95
RPS6BP0CX38 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt2.88□□□□□ -1.95
RPS6BP0CX38 BUB1YGR188C 3066 nt2.87□□□□□ -1.95
RPS6BP0CX38 NOP14YDL148C 2433 nt2.87□□□□□ -1.95
RPS6BP0CX38 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt2.87□□□□□ -1.95
RPS6BP0CX38 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt2.87□□□□□ -1.95
RPS6BP0CX38 EDS1YBR033W 2760 nt2.87□□□□□ -1.95
RPS6BP0CX38 DCP2YNL118C 2913 nt2.86□□□□□ -1.95
RPS6BP0CX38 PTP2YOR208W 2253 nt2.86□□□□□ -1.95
RPS6BP0CX38 PAA1YDR071C 576 nt2.86□□□□□ -1.95
RPS6BP0CX38 KTI11YBL071W-A 249 nt2.86□□□□□ -1.95
RPS6BP0CX38 SBE22YHR103W 2559 nt2.86□□□□□ -1.95
RPS6BP0CX38 AMS1YGL156W 3252 nt2.85□□□□□ -1.95
RPS6BP0CX38 VPS8YAL002W 3825 nt2.85□□□□□ -1.95
RPS6BP0CX38 KAP104YBR017C 2757 nt2.85□□□□□ -1.95
RPS6BP0CX38 APL2YKL135C 2181 nt2.85□□□□□ -1.95
RPS6BP0CX38 TUS1YLR425W 3924 nt2.84□□□□□ -1.95
RPS6BP0CX38 SRO77YBL106C 3033 nt2.84□□□□□ -1.95
RPS6BP0CX38 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt2.84□□□□□ -1.95
RPS6BP0CX38 YLR282CYLR282C 342 nt2.82□□□□□ -1.96
RPS6BP0CX38 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt2.82□□□□□ -1.96
RPS6BP0CX38 YNL211CYNL211C 261 nt2.82□□□□□ -1.96
RPS6BP0CX38 IFH1YLR223C 3258 nt2.82□□□□□ -1.96
RPS6BP0CX38 DGR2YKL121W 2559 nt2.81□□□□□ -1.96
RPS6BP0CX38 ESL2YKR096W 3588 nt2.81□□□□□ -1.96
RPS6BP0CX38 YBR206WYBR206W 324 nt2.81□□□□□ -1.96
RPS6BP0CX38 CAF120YNL278W 3183 nt2.81□□□□□ -1.96
RPS6BP0CX38 SMC6YLR383W 3345 nt2.81□□□□□ -1.96
RPS6BP0CX38 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.81□□□□□ -1.96
RPS6BP0CX38 MRD1YPR112C 2664 nt2.8□□□□□ -1.96
RPS6BP0CX38 OST4YDL232W 111 nt2.8□□□□□ -1.96
RPS6BP0CX38 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt2.8□□□□□ -1.96
RPS6BP0CX38 RPS30BYOR182C 192 nt2.8□□□□□ -1.96
RPS6BP0CX38 PHO91YNR013C 2685 nt2.8□□□□□ -1.96
RPS6BP0CX38 BCK1YJL095W 4437 nt2.79□□□□□ -1.96
RPS6BP0CX38 SEC26YDR238C 2922 nt2.79□□□□□ -1.96
RPS6BP0CX38 MAK10YEL053C 2202 nt2.79□□□□□ -1.96
RPS6BP0CX38 CDC31YOR257W 486 nt2.79□□□□□ -1.96
RPS6BP0CX38 YNL018CYNL018C 1839 nt2.79□□□□□ -1.96
RPS6BP0CX38 MET18YIL128W 3099 nt2.79□□□□□ -1.96
RPS6BP0CX38 FLO11YIR019C 4104 nt2.78□□□□□ -1.96
RPS6BP0CX38 MMS1YPR164W 4224 nt2.78□□□□□ -1.96
RPS6BP0CX38 CMC4YMR194C-B 222 nt2.78□□□□□ -1.96
RPS6BP0CX38 YOR055WYOR055W 435 nt2.78□□□□□ -1.96
RPS6BP0CX38 PDR1YGL013C 3207 nt2.77□□□□□ -1.97
RPS6BP0CX38 COX12YLR038C 252 nt2.77□□□□□ -1.97
RPS6BP0CX38 YPR203WYPR203W 309 nt2.77□□□□□ -1.97
RPS6BP0CX38 BNR1YIL159W 4128 nt2.77□□□□□ -1.97
RPS6BP0CX38 ARP8YOR141C 2646 nt2.76□□□□□ -1.97
RPS6BP0CX38 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt2.76□□□□□ -1.97
RPS6BP0CX38 SAP1YER047C 2694 nt2.76□□□□□ -1.97
RPS6BP0CX38 TRS130YMR218C 3309 nt2.75□□□□□ -1.97
RPS6BP0CX38 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt2.75□□□□□ -1.97
RPS6BP0CX38 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.75□□□□□ -1.97
RPS6BP0CX38 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.75□□□□□ -1.97
RPS6BP0CX38 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.75□□□□□ -1.97
RPS6BP0CX38 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.75□□□□□ -1.97
RPS6BP0CX38 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.75□□□□□ -1.97
RPS6BP0CX38 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.75□□□□□ -1.97
RPS6BP0CX38 TCB2YNL087W 3537 nt2.75□□□□□ -1.97
RPS6BP0CX38 MLH3YPL164C 2148 nt2.75□□□□□ -1.97
RPS6BP0CX38 YDR521WYDR521W 336 nt2.74□□□□□ -1.97
RPS6BP0CX38 YDR239CYDR239C 2364 nt2.74□□□□□ -1.97
RPS6BP0CX38 SGS1YMR190C 4344 nt2.73□□□□□ -1.97
RPS6BP0CX38 YOR019WYOR019W 2193 nt2.73□□□□□ -1.97
RPS6BP0CX38 SAP190YKR028W 3102 nt2.73□□□□□ -1.97
RPS6BP0CX38 TOM1YDR457W 9807 nt2.73□□□□□ -1.97
RPS6BP0CX38 ALK1YGL021W 2283 nt2.72□□□□□ -1.97
RPS6BP0CX38 MSH5YDL154W 2706 nt2.72□□□□□ -1.97
RPS6BP0CX38 GEA1YJR031C 4227 nt2.72□□□□□ -1.97
RPS6BP0CX38 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.72□□□□□ -1.97
RPS6BP0CX38 LCL1YPL056C 306 nt2.72□□□□□ -1.97
RPS6BP0CX38 NAB6YML117W 3405 nt2.71□□□□□ -1.97
RPS6BP0CX38 PRP5YBR237W 2550 nt2.71□□□□□ -1.98
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