Protein–RNA interactions for Protein: P0C2S0

CTXN2, Cortexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN2P0C2S0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTXN2P0C2S0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN2P0C2S0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN2P0C2S0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN2P0C2S0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN2P0C2S0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN2P0C2S0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN2P0C2S0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN2P0C2S0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN2P0C2S0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN2P0C2S0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN2P0C2S0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN2P0C2S0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN2P0C2S0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN2P0C2S0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN2P0C2S0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN2P0C2S0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN2P0C2S0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN2P0C2S0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN2P0C2S0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN2P0C2S0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN2P0C2S0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN2P0C2S0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms