Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC1P02654 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC1P02654 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC1P02654 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC1P02654 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC1P02654 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC1P02654 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC1P02654 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC1P02654 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC1P02654 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC1P02654 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC1P02654 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC1P02654 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC1P02654 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC1P02654 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC1P02654 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC1P02654 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC1P02654 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC1P02654 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC1P02654 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC1P02654 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC1P02654 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC1P02654 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC1P02654 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC1P02654 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC1P02654 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC1P02654 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC1P02654 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC1P02654 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC1P02654 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC1P02654 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC1P02654 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC1P02654 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC1P02654 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC1P02654 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC1P02654 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC1P02654 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC1P02654 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC1P02654 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC1P02654 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC1P02654 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC1P02654 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC1P02654 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC1P02654 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC1P02654 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC1P02654 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC1P02654 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC1P02654 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC1P02654 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC1P02654 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC1P02654 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC1P02654 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC1P02654 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC1P02654 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC1P02654 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOC1P02654 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC1P02654 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC1P02654 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC1P02654 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC1P02654 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC1P02654 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC1P02654 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC1P02654 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC1P02654 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC1P02654 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC1P02654 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC1P02654 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC1P02654 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC1P02654 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC1P02654 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC1P02654 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC1P02654 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC1P02654 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC1P02654 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC1P02654 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC1P02654 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC1P02654 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC1P02654 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC1P02654 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC1P02654 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC1P02654 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC1P02654 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC1P02654 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC1P02654 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC1P02654 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOC1P02654 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOC1P02654 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOC1P02654 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOC1P02654 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOC1P02654 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOC1P02654 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOC1P02654 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOC1P02654 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOC1P02654 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOC1P02654 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOC1P02654 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOC1P02654 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOC1P02654 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOC1P02654 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOC1P02654 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms