Protein–RNA interactions for Protein: P01733

TRBV12-3, T-cell receptor beta chain V region YT35, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV12-3P01733 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV12-3P01733 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms