Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CBFA2T2O43439 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms