Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
APAF1O14727 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
APAF1O14727 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
APAF1O14727 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
APAF1O14727 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
APAF1O14727 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APAF1O14727 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
APAF1O14727 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
APAF1O14727 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APAF1O14727 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
APAF1O14727 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
APAF1O14727 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
APAF1O14727 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
APAF1O14727 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
APAF1O14727 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APAF1O14727 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APAF1O14727 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APAF1O14727 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
APAF1O14727 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
APAF1O14727 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APAF1O14727 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APAF1O14727 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APAF1O14727 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
APAF1O14727 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APAF1O14727 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APAF1O14727 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
APAF1O14727 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APAF1O14727 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APAF1O14727 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APAF1O14727 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
APAF1O14727 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
APAF1O14727 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
APAF1O14727 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
APAF1O14727 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
APAF1O14727 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APAF1O14727 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
APAF1O14727 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APAF1O14727 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
APAF1O14727 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
APAF1O14727 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APAF1O14727 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APAF1O14727 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APAF1O14727 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
APAF1O14727 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
APAF1O14727 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
APAF1O14727 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
APAF1O14727 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
APAF1O14727 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
APAF1O14727 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
APAF1O14727 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
APAF1O14727 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
APAF1O14727 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
APAF1O14727 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
APAF1O14727 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
APAF1O14727 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
APAF1O14727 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APAF1O14727 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APAF1O14727 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APAF1O14727 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APAF1O14727 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
APAF1O14727 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
APAF1O14727 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APAF1O14727 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APAF1O14727 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APAF1O14727 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APAF1O14727 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
APAF1O14727 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APAF1O14727 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APAF1O14727 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APAF1O14727 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APAF1O14727 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
APAF1O14727 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APAF1O14727 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
APAF1O14727 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
APAF1O14727 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
APAF1O14727 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
APAF1O14727 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
APAF1O14727 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
APAF1O14727 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
APAF1O14727 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
APAF1O14727 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
APAF1O14727 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
APAF1O14727 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
APAF1O14727 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
APAF1O14727 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
APAF1O14727 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
APAF1O14727 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
APAF1O14727 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APAF1O14727 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APAF1O14727 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APAF1O14727 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APAF1O14727 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APAF1O14727 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APAF1O14727 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APAF1O14727 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APAF1O14727 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APAF1O14727 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APAF1O14727 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APAF1O14727 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APAF1O14727 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms