Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKBIEO00221 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms