Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms