Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VWA8A3KMH1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms