Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRMD3A2A2Y4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146 ms