Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 TRAJ24-201ENST00000390513 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 H2AFZP3-201ENST00000394213 387 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 IGKV1OR2-3-201ENST00000411475 288 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 OCM-202ENST00000416608 623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 SMIM12-201ENST00000417239 684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 ENTPD3-AS1-201ENST00000420850 791 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 Z74696.1-201ENST00000428208 1123 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 LINC00853-201ENST00000429328 661 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 LINC01425-202ENST00000430060 760 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AC073346.1-202ENST00000430610 544 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 LINC01508-202ENST00000436671 755 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 PSMA2-204ENST00000445517 683 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AL139237.1-201ENST00000446107 513 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 GAPDHP28-201ENST00000455134 1003 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 PTMAP1-205ENST00000455552 325 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AC096915.1-201ENST00000456185 512 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 NUTF2P4-201ENST00000458353 381 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 ACTG1P20-201ENST00000486001 468 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AC233724.1-201ENST00000503894 233 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 TRIM6-211ENST00000515022 1060 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 STX18-IT1-201ENST00000515487 542 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 LINC01170-201ENST00000519703 406 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 PGAM1P8-201ENST00000526979 453 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 HTATIP2-206ENST00000531058 1060 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AC090092.1-202ENST00000533591 685 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AC025419.1-202ENST00000535315 744 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 PSMA6-202ENST00000540871 912 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AC079362.1-202ENST00000547089 278 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 OR4N1P-201ENST00000554847 949 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 LINC02289-202ENST00000556781 861 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AC116903.1-201ENST00000557683 539 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AC027763.2-201ENST00000573755 539 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 RN7SL785P-201ENST00000578437 253 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 RN7SL49P-201ENST00000581392 298 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 ZNF493-205ENST00000596302 546 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 ZNF83-209ENST00000596930 560 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 ZSCAN26-203ENST00000611552 1030 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AC105339.4-201ENST00000624471 737 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AL356289.1-201ENST00000635446 743 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AC108477.1-201ENST00000636764 526 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AC124944.3-204ENST00000641191 150 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AC119674.1-221ENST00000641594 1213 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 LRRC8B-203ENST00000439853 7474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 ERMARD-205ENST00000418781 1841 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 GABPB2-202ENST00000368918 8964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 INTS7-204ENST00000440600 3136 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 ALG8-221ENST00000615266 1469 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 UNC5D-201ENST00000287272 8662 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 ATM-215ENST00000530958 5718 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 PGM3-212ENST00000513973 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 FBN2-203ENST00000507835 1884 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AC133552.3-201ENST00000572236 1869 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AC130464.1-201ENST00000416201 1500 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 DUXAP8-203ENST00000437781 2398 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 C15orf41-202ENST00000437989 2240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AF064858.1-201ENST00000417335 1412 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AC007388.1-201ENST00000426083 1438 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AC020549.1-201ENST00000536916 1440 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 MYOF-202ENST00000359263 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 CFAP65-201ENST00000295729 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 FMO5-203ENST00000441068 1696 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 SERPINB12-201ENST00000269491 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 PID1-201ENST00000354069 839 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 RNA5SP23-201ENST00000391006 105 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 VDAC1P8-201ENST00000406025 853 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 RPS6KA2-IT1-201ENST00000416770 579 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 FAM96B-201ENST00000422424 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AC034228.1-201ENST00000424244 923 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 SOX9-AS1-203ENST00000424417 576 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AL356309.1-201ENST00000425153 339 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AQP4-203ENST00000440832 1169 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 CHIAP1-201ENST00000456220 995 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 PPIAP28-201ENST00000458378 485 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 RN7SL870P-201ENST00000460111 296 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 RN7SL687P-201ENST00000480496 285 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AC105910.1-201ENST00000482585 483 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 NDUFS5P2-201ENST00000484004 306 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 LINC02148-201ENST00000503877 1223 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AC104123.1-202ENST00000511775 581 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 GAPDHP44-201ENST00000513513 1007 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 CTHRC1-203ENST00000520337 1198 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AC021242.2-202ENST00000522129 545 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AC044839.1-209ENST00000529769 878 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 TSPAN8-203ENST00000546561 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AC025165.2-201ENST00000549477 699 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AC211469.1-201ENST00000604263 394 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 CACNB2-214ENST00000612743 597 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 RN7SL113P-201ENST00000619959 299 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 C5orf56-207ENST00000621237 486 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AC005609.2-201ENST00000623320 592 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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