Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC112493.1-202ENST00000436019 673 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AL080317.1-201ENST00000444259 557 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 CHRM3-AS1-201ENST00000444721 486 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 RPSAP54-201ENST00000454001 886 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 KCNAB1-AS1-201ENST00000467794 456 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC126615.1-201ENST00000470084 630 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 RNA5SP460-201ENST00000516789 100 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 IGLVI-70-201ENST00000523272 390 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 OR2AL1P-201ENST00000529862 507 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 TMEM132D-AS1-206ENST00000541320 440 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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PDCD1Q15116 AC005833.4-201ENST00000542988 449 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 TMEM106C-212ENST00000549288 321 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 ACTN1-AS1-201ENST00000553944 484 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 LINC02295-201ENST00000557072 374 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 OR4N3P-201ENST00000559395 818 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 VWA3A-205ENST00000563755 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC126773.1-201ENST00000569654 547 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC125421.2-202ENST00000580776 477 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 MIR3187-201ENST00000583431 70 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 MRPS5P4-201ENST00000592830 325 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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PDCD1Q15116 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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PDCD1Q15116 AC143336.1-201ENST00000614164 836 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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PDCD1Q15116 SEC62-207ENST00000480708 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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PDCD1Q15116 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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PDCD1Q15116 GLI1-201ENST00000228682 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 NLRP3-202ENST00000348069 3828 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 ZNF10-201ENST00000248211 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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PDCD1Q15116 EIF4BP4-201ENST00000441847 1780 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 UBE2U-206ENST00000611228 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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PDCD1Q15116 MAP3K8-202ENST00000375321 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
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PDCD1Q15116 PIGA-201ENST00000333590 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
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PDCD1Q15116 LOXHD1-201ENST00000300591 3970 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
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PDCD1Q15116 IL31RA-205ENST00000396836 2426 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 LINC01358-211ENST00000635571 1687 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 TLN2-209ENST00000561311 11880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 C1GALT1C1-202ENST00000371313 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 SCFD1-202ENST00000396629 2021 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 STXBP5-AS1-209ENST00000606831 2025 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 MARF1-201ENST00000396368 7743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 MRPS17P1-201ENST00000596009 3130 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 CCDC150-201ENST00000389175 3685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 DEFB104A-201ENST00000314265 281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 DEFB104B-201ENST00000316169 281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 MTIF3-202ENST00000381120 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 FETUB-202ENST00000382134 1055 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 MIR1296-201ENST00000408136 92 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 GHRHR-204ENST00000409316 1292 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 LINC00676-201ENST00000416090 474 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
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